A coleção conta com mais de  3.000  lotes, totalizando 20 mil exemplares de 360 espécies de água doce, distribuídas em nove ordens. As famílias mais representativas são Characidae, Loricariidae e Cichlidae.

Os espécimes provêm em sua maioria do norte de Mato Grosso, principalmente dos rios Teles Pires, Juruena e bacia do rio Xingu, uma área ecotonal entre os biomas Amazônia e Cerrado, com grande potencial para a diversidade.